El propósito del controlador es doble. En primer lugar, controla la potencia de salida que recibe la bomba con la potencia de entrada disponible de los paneles solares.
En segundo lugar, un controlador generalmente proporciona una protección de bajo voltaje, por lo que el sistema se apaga, si el voltaje es demasiado bajo o demasiado alto para el rango de voltaje operativo de la bomba. Esto aumenta la vida útil de la bomba, lo que reduce la necesidad de mantenimiento.
Otras funciones auxiliares incluyen apagar automáticamente el sistema cuando el nivel de la fuente de agua es bajo o cuando el tanque de almacenamiento está lleno, regular la presión de salida del agua, mezclar la entrada de energía entre los paneles solares y una fuente de energía alternativa como la red o un grupo electrógeno. Ademas algunos controladores permiten el monitoreo y administración remota del sistema a través de un portal en línea ofrecido por el fabricante como un servicio en la nube.